Este Evangelion fue creado en la sede de Nerv en Estados Unidos. Su configuración es muy parecida a la del prototipo 01, aunque posee características especiales como la facultad de alargar las extremidades unas cuatro veces más de lo normal. Se pensó para ser pilotado por Touji Suzuhara “El Cuarto Niño”, aunque durante su transporte fue infectado por el ángel Bardiel, pasando Touji a ser un simple viajero. De éste modo tuvo que enfrentarse a los Evangelions 00, 01 y 02, siendo finalmente destruido por Shinji y el 01. Este incidente ocasionó que Touji perdiera su pierna izquierda.